必須輕拿輕放顯微鏡。拿時須用右手握鏡臂，左手托鏡座。放時天文望遠鏡讓鏡座的前端先接觸桌面，然後輕輕放下整個鏡座，避免鏡身受到震動。
為了防止透鏡被污染，應做到：1、不要用手指觸摸透鏡，以免汗液沾污；2、下降鏡筒時，一定要從旁邊注視物鏡，防止物鏡碰到蓋玻片，損壞玻片標本和物鏡；3、當觀察新鮮的標本時，一定要蓋上蓋玻片，並吸去玻片上多余的水或溶液等；4、每次用完顯微鏡後，應用擦鏡紙將目鏡、物鏡擦干淨。
不要隨意轉動准焦螺旋，觀察時必須先用粗准焦螺旋調節焦距，看清物像後再用細准焦螺旋進行微調。由於細准焦螺旋轉動有一定的顯微鏡範圍，當旋轉不動時，應將粗准焦螺旋向相反方放大鏡向轉動，然後再用細准焦螺旋調節。切不可硬行轉動，以防損壞齒輪。
觀察完畢，將玻片從載物台上取下時，必望遠鏡須先升高鏡筒，以免玻片碰擊物鏡。然後轉動轉換器，將物金相顯微鏡鏡轉到正前方，呈“八”字形。
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